針對20種物種間CK2α序列的演化性分析,從圖表中可以得到,人類(Homo sapiens,Human)的CK2α與牛亞科(Bos taurus,Bovine)親緣關係最近,與豚鼠(Cavia porcellus,Guinea pig)的親緣關係最遠。
101_1 BIOINFO FINAL
2015年2月2日 星期一
Analysis of α subunit
於CK2 subunits中,將以α subunit為例,做後續相關分析與說明。
Gene Symbols : CSNK2A1
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Molecular weight : 45,144 Da
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Isoform
由Human Protein Reference Database搜尋可知,α subunit有3種 isoform 如下:
Isoform_1
Isoform_2
Isoform_3
Introduction of Casein Kinase 2
蛋白激酶CK2最早是由Burnett, G. 和Kennedy兩人於1954年,在肝臟萃取物中使用合成的酪蛋白(Casein)做為受質而發現的,由於當時先發現了CK1(Casein kinase 1),因而以CK2稱之。它是一種於真核細胞中普遍存在的Serine/Threonine蛋白質激酶,其識別的序列往往是富含酸性胺基酸的片段,磷酸化的序列為S/T XXD/E。CK2通常以heterotetramer形式穩定存在,其組成包含二個具催化亞基 (αα,α'α'或αα';α分子量41~44
kDa、α'分子量37~42
kDa) 與二個調節亞基 (β,分子量24~26 kDa)。它們的結構高度保守,主要存在於細胞質、細胞核、細胞膜和粒線體等部分。研究已發現CK2其磷酸化下游的受質蛋白已達三百多種,過去研究指出,CK2在基因的表達、蛋白質的合成、細胞增殖及凋亡過程中扮演重要角色。
CK2 subunits
早期研究指出,CK2為一個穩定的heterotetrameric complex,伴隨著研究與分析上的精進,發現CK2於細胞中是動態的複合體,每個CK2 subunits間的交互作用是高度動態的,因此,各個subunits都獨自具有生物功能,於不同物種組織的表現量亦有所不同。
α (/α') subunit
α與α'
subunit的基因分別位在不同染色體上,其胺基酸序列有高度相似性,這兩個催化亞基於細胞中是持續的活化,可隨意進出細胞核,維持細胞週期的進行,此外,它們多數以單體的形式存在於植物中。
β subunit
β subunit為一調節亞基,以形成二聚體 (dimer) 將二個催化亞基α/α' subunit連結起來,其不僅可以調控α/α' subunit與其受質之間的結合,也可調節多種與自身結合的蛋白質激酶。
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